三阴三阳，这一术语源自中医的经典古籍《素问·天元纪大论》。它描述了阴阳之气的多少变化，具体划分为厥阴、少阴、太阴、少阳、阳明、太阳六个阶段。这六个阶段不仅仅是简单的阴阳划分，它们还各自代表着不同的生理特性、层次、经脉长短浅深、血气盛衰、病理反应、脉诊部位以及时间周期等。
在中医的古籍中，我们可以看到多种序次不同的三阴三阳描述。这些描述虽然有所不同，但大都可以归纳为上述几类。而最早对三阴三阳进行记载的文献，可能是马王堆汉墓出土的《阴阳脉死候》。该文献中提到：“凡三阳，天气也；凡三阴，地气也。”这句话为我们揭示了三阴三阳与天地之气的密切关系。
随着中医理论的发展，三阴三阳这一术语在《足臂十一脉灸经》和《阴阳十一脉灸经》中得到了进一步的运用。这两部古籍中，明确以太阳、阳明、少阳、太阴、少阴、厥阴命名经脉，成为中医医籍中最早的三阴三阳术语。
在中医理论中，三阴三阳贯透《内经》，成为其重要的理论基础。张仲景更是在此基础上，发展了《内经》的临床应用。他通过深入研究三阴三阳的生理特性、病理反应等，为中医的临床实践提供了有力的理论支持。可以说，三阴三阳不仅是中医理论的重要组成部分，也是中医临床实践的重要基石。
三阴三阳在《内经》理论中大体可分为三种内涵：