01真核生物eccDNA检测方法
▲ 实验方法概览
在真核生物中,细胞DNA多以线性染色体形态呈现,而染色体外DNA则常呈环状,被称为eccDNA。目前,研究eccDNA的实验方法主要有两种:一种是基于“Circle-Seq: Isolation and Sequencing of Chromosome-Derived Circular DNA Elements in Cells”的滚环扩增法(RCA),另一种则是参考卢煜明教授的“Identification and characterization of extrachromosomal circular DNA in maternal plasma”所采用的Tn5酶切法。RCA适合于组织和细胞样本,而Tn5酶切法则专为血浆和cfDNA样本设计。这两种方法在实验和分析结果上各有千秋,接下来,我们将深入剖析它们的异同点,以帮助您做出更明智的方案选择。
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