分子人类学可以说是近几十年来最具争议的领域之一。一些机构，尤其是得到外部资助的机构，发展分子人类学的主要原因之一是为了证明某些民族的血统论。在分子人类学出现之前，有许多言论主张“汉族是多民族杂交的，没有纯正血脉”。然而，现在通过分子人类学的研究，我们发现汉族的基因其实是最纯正的。
许多所谓的少数民族或胡人等，实际上是斗争失败后逃到游牧地的原汉人。正如古语所说：“夷狄而华夏者,则华夏之;华夏而夷狄者,则夷狄之”，古代的华/夷区别更多的是文化差异，而在人种层面其实早就统一了。真正可能污染汉民族基因的人种，早在商朝时期就已经被埋在殉葬坑里了（殷墟里发现大量高加索白人、黑人殉葬遗骨）。
满族有超过90%的父系基因来自汉族。成吉思汗的长辈和儿孙辈都检测出刘邦的直系基因。金国的完颜家是琅琊王氏的后裔，辽国的耶律家是周天子的后裔。这些家族的真实身份，真的是正儿八经的炎黄子孙。甚至连日本的初代幕府将军都是刘邦的后裔。
而汉族的基因最早能追溯到6800年前，6400年前和5400年前的三位超级父亲。他们的基因几乎覆盖了华夏大地。因此，你可以选择相信汉人基因的优越性，认为无论在哪个地方，汉人都能混到社会顶层。或者你也可以认为汉人的基因一直在朝着草原和其他周边地区完成大规模的换血。
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